水师作为远征军的一个重要兵种，这次也配合朱由崧远征大清，这是朱由崧第二次铸练新军以来，水师营第一次参加战斗。
水师的编制仍然是5万，水师的指挥使是仍然是铁臂苍龙贺兆雄。这是与明军的旧水师相同的地方。
但是新的远征军水师与旧明军水师相比，不一样的地方太多了，首先是装备的更新换代，主要表现在舰船和舰船的火力配置上。
现在大明远征军水师舰船，是清一色的超荷兰技术。因为这一时期，荷兰人的造船技术是非常厉害的，堪称是世界一流，首屈一指，要不然海上的马车夫的称号也轮不到他们。
朱由崧在吸取荷兰人造船技术的基础上，加以改进和改装，这是宋应星，宋应升哥俩和汤若望等几个军工专家，呕心沥血，日以继夜，努力了几个月的成果之一。
现在，大明的水师战舰，不但吨位大，而且航速高，顺水顺风就不用说了，有很强的逆风逆水航行能力。
而且操控舰船相对来说简单，一艘大战舰，只需要数人就可以完成操作，解放出更多的人力用于作战。
第二个明显的方面，是战舰火力配备有了很大的提升。这一点不说与明军的旧水师战舰作比，即使与先进的荷兰战舰相比，也有明显的改进。这里主要是指汤若望他们改进的大炮，装到了战舰上，而什么千斤佛郎机，原来的红衣大炮全部拆除，装上了清一色的新式大炮。
一艘大战舰，分为上下三层，一层装三门这样的大炮，这样舰船的一侧可以装九门炮，也就是说舰船的两侧装有18门大炮，另外前后各装一门大炮，这样一艘大战舰共装20门大炮，火力打击的威力和射程，已经远远超出了原来的24门舰装大炮，能够打击四面八方各个方向的敌人。
另外每艘大舰上还设有若干火枪手和弓箭手，那就实现了战力的远近覆盖，一艘战舰可以打击方圆十里地以内的范围，也就是说，一艘这样的战舰，它的作战半径可达五公里。
由于作战能力大幅度提升，新的水师战舰特别是大战舰数量上大幅度削减，不以数量求生存，而以质量求保证。
因此这5万水师，只配有一百多艘这样的大战舰，至于说轻快灵活的小型战舰，根据需要配备若干。
相对于旧明军水师和荷兰水师来说，动辄几百艘甚至几千艘战舰的时代已经过去了，这也在很大程度上节约了资源，提高了效率。
一句话，现在朱由崧的水师与以前相比，速度和战力都有了一个质的飞升。
现在明军远征军水师一百艘大战舰和数百只小舰由渤海开到了大凌河入海口处。
这期间他们遭遇了清军的两次水师。
清军当然也有水师，这些水师主要由崇祯时代投降过去的汉奸军组成，也即是汉人军队。
不过清军的水师跟现在大明的水师根本不是一个档次，因此清军水师一触即溃，根本挡不住大明远征军水师的进攻。
在龙海湾和葫芦山庄，清军数百艘战舰几万人马，根本接近不了明军的战舰，全都成了明军的靶子，一顿大炮，大都成了炮灰沉尸海底，余者仓皇而逃。
明军水师继续前进，逆风逆水如有神助，畅通无阻，很快这支舰队开到了大凌河城附近水域。